Trong hoạt động xuất nhập khẩu hàng hóa, việc xảy ra các sai sót ngoài ý muốn trên tờ khai hải quan (như nhập sai số lượng, trọng lượng, trị giá hóa đơn, áp sai mã HS Code hoặc nhầm lẫn ký hiệu container…) là điều khó tránh khỏi do khối lượng chứng từ B2B phát sinh rất lớn. Khi phát hiện ra sai lệch, thay vì hoang mang trước các chế tài thanh tra, doanh nghiệp cần chủ động kích hoạt nghiệp vụ khai báo bổ sung.

Căn cứ theo Thông tư 39/2018/TT-BTC (sửa đổi, bổ sung Thông tư 38/2015/TT-BTC của Bộ Tài chính), cơ quan Nhà nước đã có những quy định rất rõ ràng nhằm tạo điều kiện cho doanh nghiệp tự chỉnh sửa thông tin. Tuy nhiên, để không bị xử phạt vi phạm hành chính hoặc rơi vào danh sách quản lý rủi ro cao, doanh nghiệp bắt buộc phải nắm chắc các trường hợp cho phép, thời hạn nộp hồ sơ pháp lý và quy trình triển khai thực tế. Bài viết này, B Lines sẽ hướng dẫn chi tiết nghiệp vụ khai bổ sung hải quan thực chiến.

1. Các Trường Hợp Được Khai Bổ Sung Thông Tin Trên Tờ Khai Hải Quan

Không phải mọi sai sót đều có thể sửa đổi một cách tùy ý. Căn cứ theo khoản 14 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC, doanh nghiệp được phép thực hiện khai bổ sung thông tin trong các bối cảnh cụ thể sau:

• Khai bổ sung trong thông quan (Khi hàng chưa giải phóng): Doanh nghiệp tự phát hiện sai sót sau khi hệ thống đã tiếp nhận tờ khai nhưng trước thời điểm cơ quan hải quan quyết định thông quan hàng hóa.
• Khai bổ sung sau khi hàng đã thông quan: Trong vòng 60 ngày kể từ ngày thông quan và trước thời điểm cơ quan hải quan ban hành quyết định kiểm tra sau thông quan, thanh tra chuyên ngành. Nếu doanh nghiệp tự phát hiện sai sót về thuế, trị giá, xuất xứ trong khoảng thời gian này và chủ động khai báo thì sẽ được xem xét giảm nhẹ chế tài.
• Khai bổ sung theo yêu cầu của Hải quan: Khi cán bộ hải quan chuyên trách kiểm tra hồ sơ (Luồng Vàng) hoặc kiểm hóa thực tế (Luồng Đỏ) phát hiện ra sai lệch giữa chứng từ và thực tế hàng hóa, họ sẽ phát hành thông báo trên hệ thống VNACCS yêu cầu doanh nghiệp phải thực hiện khai sửa đổi, bổ sung thông tin.

Các chỉ tiêu thông tin KHÔNG ĐƯỢC PHÉP KHAI BỔ SUNG (Bắt buộc phải hủy tờ khai):

Doanh nghiệp cần đặc biệt lưu ý các chỉ tiêu cốt lõi không thể sửa đổi trên mạng hệ thống bao gồm: Mã loại hình xuất nhập khẩu, Mã chi cục hải quan cửa khẩu, Mã người nhập khẩu/người xuất khẩu. Nếu sai các thông tin này, doanh nghiệp bắt buộc phải làm thủ tục xin hủy tờ khai hải quan và truyền lại tờ khai mới.

2. Thời Hạn Nộp Hồ Sơ Khai Bổ Sung Và Nghĩa Vụ Thuế Đi Kèm

Yếu tố thời gian đóng vai trò quyết định đến việc doanh nghiệp có bị phạt tiền hay không khi thực hiện nghiệp vụ này. Thông tư 39/2018/TT-BTC quy định các cột mốc thời gian cốt lõi:

• Thời hạn xử lý hồ sơ sau thông quan: Việc khai bổ sung thông tin ảnh hưởng đến số thuế phải nộp phải được thực hiện trong thời hạn 60 ngày kể từ ngày thông quan chính thức của lô hàng.
• Thời hạn nộp tiền thuế chênh lệch (nếu có): Trường hợp việc khai bổ sung làm tăng số thuế phải nộp (ví dụ: điều chỉnh tăng trị giá CIF hoặc áp lại mã HS Code có thuế suất cao hơn), doanh nghiệp phải nộp toàn bộ số tiền thuế tăng thêm cùng tiền phạt chậm nộp thuế vào ngân sách nhà nước trong thời hạn quy định kể từ ngày nhận được thông báo phê duyệt hồ sơ khai bổ sung.
• Trường hợp phát sinh số thuế nộp thừa: Nếu việc sửa đổi làm giảm số thuế phải nộp, cơ quan hải quan sẽ thực hiện hoàn trả số thuế nộp thừa hoặc bù trừ vào nghĩa vụ thuế của các lô hàng nhập khẩu tiếp theo của doanh nghiệp sau khi hồ sơ được phê duyệt hoàn thành.

3. Bộ Hồ Sơ Khai Bổ Sung Hải Quan Chuẩn Hóa Theo Quy Định

Để nộp hồ sơ xin sửa đổi tờ khai trên hệ thống Một cửa quốc gia và xuất trình cho Chi cục hải quan quản lý, doanh nghiệp cần tập hợp đầy đủ các chứng từ chứng minh tính trung thực của việc sai sót. Bộ hồ sơ bao gồm:

1. Văn bản đề nghị khai bổ sung thông tin (Mẫu số 03/KBS/GSQL ban hành kèm Thông tư 39/2018/TT-BTC): Ghi rõ lý do tại sao xảy ra sai sót, liệt kê chi tiết các chỉ tiêu thông tin cũ và thông tin mới cần thay đổi.
2. Tờ khai hải quan bổ sung điện tử (Mã nghiệp vụ HYS trên hệ thống phần mềm ECUS5).
3. Hóa đơn thương mại (Commercial Invoice) & Phiếu đóng gói hàng hóa (Packing List) bản gốc: Bản chứng từ chính xác của đối tác nước ngoài phát hành để đối chiếu thông tin.
4. Chứng từ thanh toán quốc tế qua ngân hàng (Swift, Lệnh chuyển tiền, T/T, L/C): Đây là bằng chứng đanh thép nhất để chứng minh giá trị thực tế của lô hàng khi doanh nghiệp khai bổ sung tăng/giảm trị giá tính thuế.
5. Vận đơn đường biển/đường hàng không (Bill of Lading / Airway Bill).
6. Tài liệu kỹ thuật (Catalogue), kết quả phân tích phân loại, kết quả giám định (nếu khai bổ sung liên quan đến tên hàng, mã HS Code hoặc chính sách mặt hàng).

4. Trách Nhiệm Pháp Lý Và Mức Xử Phạt Khi Chậm Trễ Khai Bổ Sung

Việc chậm trễ hoặc cố tình trốn tránh không khai bổ sung khi đã phát hiện ra sai sót sẽ đẩy doanh nghiệp vào những rủi ro pháp lý nặng nề căn cứ theo Nghị định xử phạt vi phạm hành chính trong lĩnh vực hải quan:

• Trường hợp tự nguyện khai báo đúng thời hạn: Nếu doanh nghiệp tự phát hiện sai sót ảnh hưởng đến thuế và làm thủ tục khai bổ sung trong thời hạn 60 ngày (trước khi hải quan công bố quyết định thanh tra), doanh nghiệp chỉ phải nộp số tiền thuế thiếu và tiền chậm nộp tính theo tỷ lệ phần trăm quy định của luật quản lý thuế (thường là 0.03%/ngày tính trên số tiền thuế chậm nộp), đồng thời được miễn phạt tiền vi phạm hành chính.
• Trường hợp bị cơ quan chức năng phát hiện trước: Nếu doanh nghiệp không chủ động khai báo mà để cơ quan hải quan phát hiện ra sai lệch thông qua khâu kiểm tra sau thông quan hoặc thanh tra thuế, doanh nghiệp sẽ bị:
  • Ấn định số thuế phải nộp.
  • Phạt tiền từ 10% đến 20% số tiền thuế khai thiếu hoặc số tiền thuế được miễn, giảm, hoàn cao hơn so với quy định của pháp luật.
  • Đối với các hành vi cố tình khai sai tên hàng, mã HS Code để trốn thuế quy mô lớn, doanh nghiệp có thể bị xử phạt từ 1 đến 3 lần số tiền thuế trốn và bị hạ bậc uy tín trên hệ thống quản lý rủi ro, đẩy toàn bộ các lô hàng sau này vào luồng đỏ kiểm hóa bắt buộc.

Kết Luận

Khai bổ sung hải quan theo Thông tư 39/2018/TT-BTC là một nghiệp vụ cứu cánh, bảo vệ quyền lợi hợp pháp cho doanh nghiệp trước những nhầm lẫn vô ý trong quá trình làm chứng từ xuất nhập khẩu. Tuy nhiên, tính chất cốt lõi của nghiệp vụ này đòi hỏi sự nhanh chóng, minh bạch về mặt hồ sơ tài chính và kỹ năng giải trình thực chiến với cán bộ tổng cục hải quan. Việc kéo dài thời gian không xử lý hồ sơ chỉ làm tăng số tiền phạt lũy tiến và làm xấu đi lịch sử pháp lý của doanh nghiệp trên hệ thống quản lý quốc gia.

Tại B Lines, chúng tôi cung cấp giải pháp khai thuê hải quan và xử lý hồ sơ sửa đổi sau thông quan trọn gói, chuyên nghiệp. Với đội ngũ chuyên viên am hiểu tường tận Thông tư 39/2018/TT-BTC, B Lines cam kết hỗ trợ doanh nghiệp rà soát chứng từ, phát hiện nhanh sai sót, lên phương án áp mã HS Code chính xác và đại diện giải trình hồ sơ khai bổ sung HYS siêu tốc tại các chi cục hải quan lớn. Kết hợp cùng năng lực điều độ mạnh mẽ của đội xe đầu kéo moóc xương, moóc sàn chuyên dụng, B Lines tự tin giúp chuỗi cung ứng của bạn luôn vận hành đúng luật, an toàn và tối ưu hóa biên độ chi phí tài chính thấp nhất.

Quý doanh nghiệp cần tư vấn chuyên sâu về hồ sơ sửa đổi tờ khai, tính toán tiền chậm nộp thuế hoặc nhận báo giá dịch vụ hải quan và vận tải nội địa trọn gói, hãy liên hệ ngay với phòng dịch vụ khách hàng của chúng tôi:

• Hotline hỗ trợ nghiệp vụ 24/7: 0909 288 639
• Email tiếp nhận thông tin hồ sơ: agm1@blines.com.vn
• Website chính thức: https://blines.com.vn

B Lines – Minh bạch pháp lý, vững vàng giải pháp, tăng tốc chuỗi cung ứng toàn diện!

---

🔝 10 Lý Do Hàng Đầu Nên Chọn "B" LINES Cho Giải Pháp Logistics

• Giải Pháp Logistics Toàn Diện và Tích Hợp
• Chuyên Môn Sâu Về Vận Tải Đa Phương Thức
• Năng Lực Xử Lý Hàng Dự Án & Chuyên Dụng Nổi Bật
• Tối Ưu Hóa Chi Phí Vận Tải Cạnh Tranh
• Thủ Tục Hải Quan Nhanh Chóng và Chính Xác
• Mạng Lưới Phủ Sóng Rộng Khắp
• Cam Kết An Toàn Hàng Hóa Tuyệt Đối
• Ứng Dụng Công Nghệ Giám Sát Hiện Đại
• Đội Ngũ Chuyên Gia Giàu Kinh Nghiệm và Tận Tâm
• Đối Tác Chiến Lược, Không Chỉ Là Nhà Vận Chuyển